Wizualizacja procesu replikacji DNA w badaniach doktorantki SDNSiP - realizacja projektu PRELUDIUM (NCN)

Bobik jest powszechnie uprawianą rośliną strączkową, znaną z jej wysokiej odporności na ciężkie warunki środowiskowe (w tym zwiększone zasolenie, czy długotrwałe susze). W trakcie badań udało się wykazać znaczne zmiany w ekspresji białek związanych ze stabilizacją zahamowanych widełek replikacyjnych
w warunkach stresogennych – mechanizm ten działa bez zarzutu nawet w przypadku dłuższego działania czynników środowiskowych, co bezpośrednio przyczynia się do znacznej odporności rośliny. Jednym
z technicznych osiągnięć projektu było przeprowadzenie podwójnej detekcji replikacji za pomocą dwóch pozornie niekompatybilnych metod – włączania 5-etynylo-2’-deoxyurydyny (EdU) oraz 5-jodo-2’-deoxyurydyny (IdU). Sukces metody pozwolił na wizualne zobrazowanie zmian w aktywności replikacji
w trakcie, oraz po wystąpieniu warunków indukujących stres. Dodatkowo, opracowane zostały dwie metody modelowania 3D wykorzystujące oprogramowanie typu open source – Blender 3D. Metody te mogą zostać z powodzeniem użyte przez biologów nieposiadających dostępu do specjalistycznych (często odpłatnych) oprogramowań. Badania prowadzone są pod kierunkiem dr hab. Doroty Rybaczek, prof. UŁ z Katedry Cytofizjologii Wydziału Biologii i Ochrony Środowiska UŁ .